杂种一代有许多优点，在某些方面比近交系更适用于科学研究。
1.遗传和表型上的一致性  就某些生物学的特征而言，杂种一代比近交系动物具有更高的一致性，不容易受环境因素变化的影响，广泛适用于营养、药物、病原和激素的生物评价。
2.杂交优势  杂种一代具有较强的生命力，对疾病的抵抗力强，寿命较长，容易饲养，适用于携带保存某些有害基因和长时间的慢性致死实验，也可作为代乳动物以及卵、胚胎和卵巢移植的受体。
3.具有同基因性  杂交F1代动物虽然具有杂合的遗传组成，但其可接受同系不同个体乃至接受两个亲本品系的细胞、组织、器官和肿瘤的移植，适用于免疫学和发育生物学等领域的研究。例如单克隆抗体研究一般都用BALB/c品系小鼠，将获得的杂交瘤细胞注入该小鼠腹腔后即可产生肿瘤，同时产生高效价抗体的腹水。如采用BALB/c和其他近交系杂交产生的F1代小鼠制备单克隆抗体，所产生的高效价抗体腹水量比用BABL/c小鼠要多。
4.作为某些疾病研究的模型  例如NZB×NZWF1是自身免疫缺陷的模型， C3H×IFF1为肥胖病和糖尿病的模型。